Struktur Organisasi Dinas Pertanian dan Pangan terdiri dari:
a. Unsur Pimpinan : Kepala Dinas;
b. Unsur Pembantu Pimpinan : Sekretaris yang terdiri dari Subbagian-subbagian;
c. Unsur Pelaksana : Bidang-bidang yang terdiri dari Seksi-seksi; UPT; dan
d. Kelompok Jabatan Fungsional
Berikut susunan organisasi Dinas Pertanian dan Pangan :
Plt. Kepala Dinas : drh Krisna Berlian
Sekretariat
Sekretaris : Ir. Raharjo Yuwono, MM
Subbagian Umum : Nur Elia Mujahidah, S.Sos
Subbagian Keuangan : Ris Heryani, SE, M.Ec.Dev.
Subbagian Perencanaan : Danang Sutopo, S.Hut.T
Bidang Tanaman Pangan
Kepala : Rismiyadi, S.P, M.Si
Seksi Produksi Tanaman Pangan : -
Seksi Perlindungan Tanaman Pangan : Ari Widyastuti, SP
Seksi Sarana dan Prasarana Tanaman Pangan : Yatimah, SP
Bidang Perkebunan dan Hortikultura
Kepala : Ir. Luh Gede Suastini
Seksi Produksi Perkebunan dan Hortikultura : Sugiyanto, SP
Seksi Perlindungan Perkebunan dan Hortikultura : Mukhawi, S.TP
Seksi Sarana dan Prasarana Perkebunan dan Hortikultura : Eny Wijayanah, SP
Bidang Peternakan
Kepala : Ir. Suseno Budi Sulistyanto
Seksi Kesehatan Hewan dan Kesehatan Masyarakat Veteriner : Fitria Puspita Wardani, SPt, M.Ec.Dev
Seksi Produksi dan Perbibitan Ternak : Sunarto, S.ST
Seksi Sarana dan Prasarana Peternakan : Wiwit Latif H, S.TP
Bidang Pengolahan dan Pemasaran Hasil Pertanian
Kepala : Ir. Joko Priyono, M.Si
Seksi Pengolahan Hasil Pertanian : Sustiwiningsih, S.TP
Seksi Bina Mutu Hasil Pertanian : Wakijo, S.Sos
Seksi Pemasaran Hasil Pertanian : Fardiana Ekasari, SP
Bidang Penyuluhan
Kepala : drh. Retno Widyastuti
Seksi Kelembagaan : Slamet Widodo, S.ST
Seksi Ketenagaan : Wibowo Purno Katoto, S.TP, M.Si
Seksi Programa : Budiyono, S.ST
Bidang Ketahanan Pangan
Kepala : Hana Kadaton Adinoto, SP, MP
Seksi Ketersediaan dan Distribusi Pangan : Ratna Briani, SP
Seksi Keamanan Pangan : Giyanto, SP
Seksi Penganekaragaman Konsumsi Pangan : Ir. Heru Santosa
Unit Pelaksana Teknis (UPT)
UPT Perbenihan Tanaman Pangan
Kepala : -
Subbagian Tata Usaha : -
UPT Laboratorium Kesehatan Hewan
Kepala : Gesit Handoyo, ST
Subbagian Tata Usaha : Agus Puji Widianto, S.ST
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Nglipar
Kepala : Sumarni, S.ST
Subbagian Tata Usaha : Wargito, A.Md
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Panggang
Kepala : Agus Susanto, A.Md
Subbagian Tata Usaha : Wiwit Astuti, S.K.H
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Semanu
Kepala : drh. Martini
Subbagian Tata Usaha : Suharyati P. S.Sos
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Wonosari
Kepala : drh. Rianawati
Sub Bagian Tata Usaha : Eny Susilowati, S.Pt
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Karangmojo
Kepala : -
Subbagian Tata Usaha : Rustini Dwi Widyastuti, S.Pt
UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Playen
Kepala : drh. Yanno Findria S
Subbagian Tata Usaha : Suyadi, S.Pt
dan Kelompok Jabatan Fungsional
Bagan Struktur Organisasi Dinas Dinas Pertanian dan Pangan dapat dikunjungi di sini