Struktur Organisasi Dinas Pertanian dan Pangan terdiri dari:

a. Unsur Pimpinan : Kepala Dinas; 

b. Unsur Pembantu Pimpinan : Sekretaris yang terdiri dari Subbagian-subbagian;

c. Unsur Pelaksana : Bidang-bidang yang terdiri dari Seksi-seksi; UPT; dan

d. Kelompok Jabatan Fungsional

Berikut susunan organisasi Dinas Pertanian dan Pangan :

Plt. Kepala Dinas : drh Krisna Berlian

Sekretariat
Sekretaris :  Ir. Raharjo Yuwono, MM
Subbagian Umum : Nur Elia Mujahidah, S.Sos
Subbagian Keuangan : Ris Heryani, SE, M.Ec.Dev.
Subbagian Perencanaan : Danang Sutopo, S.Hut.T

Bidang Tanaman Pangan
Kepala : Rismiyadi, S.P, M.Si
Seksi Produksi Tanaman Pangan : -
Seksi Perlindungan Tanaman Pangan : Ari Widyastuti, SP
Seksi Sarana dan Prasarana Tanaman Pangan : Yatimah, SP

Bidang Perkebunan dan Hortikultura
Kepala : Ir. Luh Gede Suastini
Seksi Produksi Perkebunan dan Hortikultura : Sugiyanto, SP
Seksi Perlindungan Perkebunan dan Hortikultura : Mukhawi, S.TP
Seksi Sarana dan Prasarana Perkebunan dan Hortikultura : Eny Wijayanah, SP

Bidang Peternakan
Kepala : Ir. Suseno Budi Sulistyanto
Seksi Kesehatan Hewan dan Kesehatan Masyarakat Veteriner : Fitria Puspita Wardani, SPt, M.Ec.Dev
Seksi Produksi dan Perbibitan Ternak : Sunarto, S.ST
Seksi Sarana dan Prasarana Peternakan : Wiwit Latif H, S.TP

Bidang Pengolahan dan Pemasaran Hasil Pertanian
Kepala : Ir. Joko Priyono, M.Si
Seksi Pengolahan Hasil Pertanian : Sustiwiningsih, S.TP
Seksi Bina Mutu Hasil Pertanian : Wakijo, S.Sos
Seksi Pemasaran Hasil Pertanian : Fardiana Ekasari, SP

Bidang Penyuluhan
Kepala : drh. Retno Widyastuti
Seksi Kelembagaan : Slamet Widodo, S.ST
Seksi Ketenagaan : Wibowo Purno Katoto, S.TP, M.Si
Seksi Programa : Budiyono, S.ST

Bidang Ketahanan Pangan
Kepala : Hana Kadaton Adinoto, SP, MP
Seksi Ketersediaan dan Distribusi Pangan : Ratna Briani, SP
Seksi Keamanan Pangan : Giyanto, SP
Seksi Penganekaragaman Konsumsi Pangan : Ir. Heru Santosa


Unit Pelaksana Teknis (UPT)

UPT Perbenihan Tanaman Pangan
Kepala : -
Subbagian Tata Usaha : -

UPT Laboratorium Kesehatan Hewan
Kepala : Gesit Handoyo, ST
Subbagian Tata Usaha : Agus Puji Widianto, S.ST

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Nglipar
Kepala : Sumarni, S.ST
Subbagian Tata Usaha : Wargito, A.Md

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Panggang
Kepala : Agus Susanto, A.Md
Subbagian Tata Usaha : Wiwit Astuti, S.K.H

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Semanu
Kepala : drh. Martini
Subbagian Tata Usaha : Suharyati P. S.Sos

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Wonosari
Kepala : drh. Rianawati
Sub Bagian Tata Usaha : Eny Susilowati, S.Pt

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Karangmojo
Kepala : -
Subbagian Tata Usaha : Rustini Dwi Widyastuti, S.Pt

UPT Pusat Kesehatan Hewan Kecamatan Playen
Kepala : drh. Yanno Findria S
Subbagian Tata Usaha : Suyadi, S.Pt

dan Kelompok Jabatan Fungsional

Bagan Struktur Organisasi Dinas Dinas Pertanian dan Pangan dapat dikunjungi di sini